TAP GARP_ARR-B in Setaria italica

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Cenchrinae; Setaria

Protein source: Phytozome v11


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules


(Domain names are clickable)
Please note: One of the domains G2-like_Domain and Myb_DNA-binding are sufficient for a protein to be classified as TAP GARP_ARR-B.


List of proteins (12)

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namename additionClick button to show/hide sequence: Download sequence?
Seita.1G061200.1.ppacid=32696022 transcript=Seita.1G061200.1 locus=Seita.1G061200 ID=Seita.1G061200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.1G351300.1.ppacid=32696008 transcript=Seita.1G351300.1 locus=Seita.1G351300 ID=Seita.1G351300.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.4G050700.1.ppacid=32706955 transcript=Seita.4G050700.1 locus=Seita.4G050700 ID=Seita.4G050700.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.4G198300.1.ppacid=32708506 transcript=Seita.4G198300.1 locus=Seita.4G198300 ID=Seita.4G198300.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.4G198500.1.ppacid=32708971 transcript=Seita.4G198500.1 locus=Seita.4G198500 ID=Seita.4G198500.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.4G198600.1.ppacid=32707926 transcript=Seita.4G198600.1 locus=Seita.4G198600 ID=Seita.4G198600.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.4G215900.1.ppacid=32707874 transcript=Seita.4G215900.1 locus=Seita.4G215900 ID=Seita.4G215900.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.5G419200.1.ppacid=32682866 transcript=Seita.5G419200.1 locus=Seita.5G419200 ID=Seita.5G419200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G055200.1.ppacid=32704063 transcript=Seita.7G055200.1 locus=Seita.7G055200 ID=Seita.7G055200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G057700.1.ppacid=32703788 transcript=Seita.7G057700.1 locus=Seita.7G057700 ID=Seita.7G057700.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G231000.1.ppacid=32691934 transcript=Seita.9G231000.1 locus=Seita.9G231000 ID=Seita.9G231000.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G485100.1.ppacid=32693335 transcript=Seita.9G485100.1 locus=Seita.9G485100 ID=Seita.9G485100.1.v2.2 annot-version=v2.2
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A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

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¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
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